Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIRE2Q8WWL2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIRE2Q8WWL2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms