Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM41Q8WV44 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms