Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms