Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RNF169Q8NCN4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF169Q8NCN4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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