Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms