Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC18Q8N456 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC18Q8N456 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC18Q8N456 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC18Q8N456 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC18Q8N456 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRC18Q8N456 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms