Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROM2Q8N271 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms