Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms