Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4BP2Q86UW6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
N4BP2Q86UW6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms