Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms