Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms