Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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