Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHST3Q7LGC8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST3Q7LGC8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms