Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q71RC1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q71RC1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q71RC1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q71RC1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q71RC1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms