Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms