Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRCAPQ6ZRS2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRCAPQ6ZRS2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms