Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms