Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT2Q6NUI2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT2Q6NUI2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms