Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSAPQ6IQ19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms