Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms