Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

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Length 1,092 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USPL1Q5W0Q7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
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