Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL1Q5VZK9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL1Q5VZK9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms