Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf53Q5VUE5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms