Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms