Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RPRD2Q5VT52 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms