Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP350Q5VT06 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP350Q5VT06 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms