Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms