Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWISTNBQ3B726 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms