Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms