Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC96Q2M329 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms