Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms