Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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