Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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