Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN1Q16658 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms