Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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