Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SGCAQ16586 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCAQ16586 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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