Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK4Q16099 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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