Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF2Q15853 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USF2Q15853 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USF2Q15853 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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