Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCOA1Q15788 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
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