Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALX1Q15699 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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