Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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