Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-1Q15270 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms