Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRKQ15262 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRKQ15262 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
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