Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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