Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAPTM4AQ15012 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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