Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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