Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 GOLGB1-205ENST00000482512 10295 ntTSL 1 (best)5.85□□□□□ -1.472e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NAP1L1-220ENST00000551524 460 ntTSL 27.72□□□□□ -1.171e-323■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 57.22□□□□□ -1.258e-12■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-9■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.416e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.416e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 C9orf78-204ENST00000461762 2390 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-12■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-204ENST00000561983 1044 ntTSL 525.73■■□□□ 1.712e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-209ENST00000563134 736 ntTSL 225.06■■□□□ 1.62e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-214ENST00000566214 683 ntTSL 524.97■■□□□ 1.592e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-216ENST00000567017 1094 ntTSL 524.4■■□□□ 1.52e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-219ENST00000568950 1343 ntTSL 523.48■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-226ENST00000570280 708 ntTSL 322.7■■□□□ 1.222e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-210ENST00000563637 993 ntTSL 521.36■■□□□ 1.012e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-205ENST00000562333 1052 ntTSL 520.61■□□□□ 0.892e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-211ENST00000563776 923 ntTSL 319.61■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-215ENST00000566965 879 ntTSL 519.42■□□□□ 0.72e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 217.23■□□□□ 0.352e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-224ENST00000569943 635 ntTSL 316.39■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 11.2
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PUM1Q14671 RHOT2-203ENST00000561929 625 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-8■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 421.13■□□□□ 0.972e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 DDX23-218ENST00000553182 779 ntTSL 315.34■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.235e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.065e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.315e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NT5DC2-212ENST00000487779 536 ntTSL 312.42□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.65e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 ANKHD1-209ENST00000431508 4079 ntTSL 26.72□□□□□ -1.335e-13■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 ANKHD1-211ENST00000433049 3649 ntTSL 56.25□□□□□ -1.415e-13■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.982e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.92e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.072e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 214.1□□□□□ -0.152e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.639e-8■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 PRC1-216ENST00000559828 584 ntTSL 39.45□□□□□ -0.91e-10■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.486e-9■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.534e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.494e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 514.31□□□□□ -0.124e-6■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.319e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.489e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.549e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.649e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.479e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 BIRC5-208ENST00000590925 648 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.692e-16■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 BIRC5-206ENST00000589892 747 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-16■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-16■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-16■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-16■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 UBTF-208ENST00000529373 674 ntTSL 222.13■■□□□ 1.132e-8■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 METAP2-206ENST00000549136 388 ntTSL 27.13□□□□□ -1.272e-19■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 519.45■□□□□ 0.73e-23■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)10.13□□□□□ -0.791e-7■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-8■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-8■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 216.04■□□□□ 0.162e-8■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.631e-12■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-12■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-12■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-12■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 MRFAP1-204ENST00000512914 1982 nt15.37■□□□□ 0.051e-12■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 DHX37-203ENST00000539298 4550 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.313e-8■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-8■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 DDX10-201ENST00000322536 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.238e-7■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 GSPT1-208ENST00000565267 1864 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 323.18■■□□□ 1.35e-17■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.235e-17■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.51□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 SRRT-204ENST00000448764 1607 ntTSL 515.72■□□□□ 0.116e-8■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 YWHAQ-203ENST00000446619 665 ntTSL 321.42■■□□□ 1.025e-9■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.255e-9■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.345e-9■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 SFSWAP-203ENST00000535236 5593 ntTSL 1 (best)17.85■□□□□ 0.454e-7■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 CAST-235ENST00000511097 1399 ntTSL 517.45■□□□□ 0.383e-7■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 CAST-208ENST00000421689 913 ntTSL 511.37□□□□□ -0.593e-7■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 CAST-242ENST00000515063 654 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.633e-7■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 CAST-238ENST00000512620 904 ntTSL 53.88□□□□□ -1.793e-7■□□□□ 11.1
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