Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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