Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A3Q14050 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms