Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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